Ничего страшного, что в гидросистеме будет силикон
Ничего страшного в этом нет. Я при ремонте силиконом смазывал все трущиеся детали.
Достаточно ли для замены манжет и штока снять только блок электромагнитных клапанов, а не робота полностью ?
Если менять только манжету цилиндра сцепления (большую), то достаточно, а если манжеты передач, то нужно снимать весь.